JBrowse2

JBrowse 2简介

JBrowse2 与 JBrowse1的差异可见https://jbrowse.org/jb2/features/。

Note

在JBrowse2中不支持URL交互。

安装配置

根据此页面进行安装配置: https://jbrowse.org/jb2/docs/combined/。

以下为cottonMD中棉花的配置文件, 可作为参考: http://yanglab.hzau.edu.cn/static/jbr_conf/config.json。

其它

通过jbrowse2中的分享功能可以设置默认页面

Note

直接复制页面url链接无法保存当前jbr页面。

设置后台运行

#查看所有会话
screen -ls
#创建
screen -S jbrowse2
#进入会话
screen -r jbrowse2
#在jbrowse2安装目录中运行以下命令将会在7000端口启动jbrowse2
npx serve -l 7000 .
#退出
screen -d jbrowse2